1) Pusťte své R do oblak – Petr Šimeček, chovatel myší

• Docker běží i pod Windows.
• Stáhne si to virtuální mašinu z Dockerhubu, tam je 45 tisíc veřejně přístupných kódů.
• Lze si takto zafixovat stejnou verzi R i celé prostředí, stejně jako na nějakém virtuálním image. Ideální pro práci větších týmů nebo výuku, kde musí být všechna prostředí ve stejné výchozí pozici.
• Pro R už je připravený obraz Rocker, v něm varianta r-studio s RStudio Serverem.
• Balíček hadleyverse má připraveny všechny podstatné balíčky včetně ggplot2.
• Docker se dá hostovat přes Microsoft Azure Marketplace, A­mazon EC2 Container Service nebo Google Cloud.
• Petr měl zkušenosti s hostováním přes službu Digital Ocean (aff odkaz Petra).
  • Je jednodušší na ovládání.
  • 10 dolarů by mělo stačit na 2 měsíce při paměti 1 GB; zhruba cent za hodinu na stroj.
  • Je to čistě Linux, Ubuntu.
  • Předinstalované aplikace – Docker
• Za ShinyApps.io už se začalo platit, je levnější jet přes Digital Ocean.
• Petr se k Dockeru přihlašuje svým SSL certifikátem přes SSH.
• Odkaz na realizaci RStudia v cloudu: http://sas-and-r.blogspot.cz/2014/12/­rstudio-in-cloud-for-dummies-20142015.html
• Petrův blog: http://applyr.blogspot.cz/

2) Anastassiya Zidkova, genetička v MSD

• PhdD z oboru Molekulární a buněčné biologie, genetiky a virologie.

• Používá admixture model, sleduje historickou migraci obyvatel dle jejich stopy v DNA.

• Líbila se mi celá prezentace, ale nezapisoval jsem si. Proklikejte si https://github.com/…azie/Rmeetup
• Co mne zaujalo: když A­nastázie potřebuje ukázat nějakou složitou vizualizaci, vsune před to v prezentaci pří­pravný slide, aby lidem představila, o co půjde.

…a po takovém slidu již následuje brutalitka.

3) Tomáš Hovorka a Martin Horáček, Median

• Provozují něco jako peoplemeter, ale pro rádia – aplikace v mobilním telefonu, pořád poslouchá zvuk, posílá data do Medianu, dělají audiomatching s tím, co se vysílalo v rádiích.

• Denně se z telefonu přenáší jen 1 MB dat (jen hashů).
• Pokud vás ten projekt zajímá více, projděte si smlouvu s Českým rozhlasem.
• Zajímavé postřehy např. o přepínání rádia po hodinových programech.
• Kluci sdíleli své pragmatické zku­šenosti s rozvojem takového systému.
• Přijímání dat přes C#, ukládá do SQL.
• R pak čistí data, dělá reporting.
• Z prototypu se stal produkt, co už pět let funguje.
• Rychlejší vzhledem k agilnímu vývoji.
• Cca 60 R souborů + 5 Sweave šablon
  • Kombinace texu a R.
  • Šablony na týdenní reporty a měsíční, pak to projedou pdflatexem.
  • Tehdy asi ještě nebyl R Markdown.
• Načítají data z MSSQL, zprocesují, uloží zpět do MSSQL včetně toho reportu
• Rabbit na fronty, distribuce úloh v clusteru audiomatchingu.
• Knihovna rmongodb.
• Rodbc pro MSSQL, mySQL.
• Logování přes sink.
• tryCatch kvůli odladění, proč něco spadlo.
• daří se jim udržet zarovnání kódu, protože Rstudio to dělá samo.
• Používají krásné poznámky v kódu: PRASE/TODO.
• Mají vlastní skript na hledání funkcí ve skriptech, které už se nikde nepoužívají.
• Na version control používají TortoiseSVN.
• RShiny - když jim napočítání trvá dlouho, používají tlačítko obnovit.
  • Pro ladění mají v Shiny záložku session log, kde trackují chyby.
• Statistiky dělají hodně v rámci SQL.
• Výpočty dělají v C#.
• V R kreslí grafy.
• Neumí vykreslit „č“ v pdf grafu, aby byl vidět v Acrobatu. Kdo to vyřešil, ať se jim ozve.

Ohlášky navíc